Pandemi COVID-19 masih jauh dari selesai, sehingga komunitas ilmiah terus mengembangkan cara untuk mendeteksi, melawan, dan mengobati infeksi virus. Perkembangan terbaru dalam komunitas riset adalah metode pengujian yang lebih cepat untuk diagnosis yang lebih cepat.
Dalam studi baru yang diterbitkan dalam edisi terbaru Cell Reports Methods, tim peneliti merinci metode lanjutan mereka untuk memeriksa respons kekebalan tubuh terhadap COVID-19 pada tingkat molekuler. Terobosan teknologi ini dapat mengubah cara diagnosis penyakit karena berpotensi tertular infeksi beberapa jam setelah terpapar.
Tes yang ada mengandalkan bahan virus yang dapat dideteksi dari infeksi. Jadi ketika tidak ada cukup bahan virus yang terakumulasi di tempat infeksi, deteksi atau diagnosis dini tidak mungkin dilakukan. Dengan teknik baru, respons imun diukur sejak gen tertentu diaktifkan saat serangan virus dimulai.
“Host-based response assays (HRA) seringkali dapat mendiagnosis penyakit menular lebih awal dan lebih tepat daripada tes berbasis patogen. Namun, peran splicing alternatif RNA (AS) dalam HRA masih belum dijelajahi, karena HRA yang ada terbatas pada tanda tangan ekspresi gen, ”jelas tim.
“Kami melaporkan kerangka kerja komputasi untuk identifikasi, optimalisasi, dan evaluasi pengembangan uji diagnostik berbasis AS darah untuk penyakit menular. Dengan menggunakan infeksi SARS-CoV-2 sebagai studi kasus, kami mendemonstrasikan peningkatan akurasi biomarker AS untuk diagnosis COVID-19 bila dibandingkan dengan enam tanda tangan transkriptom yang dilaporkan dan bila diterapkan sebagai uji diagnostik PCR mikrofluida.”
Setelah menguji kerangka kerja untuk menyelidiki variasi AS dalam kohort prospektif besar yang disebut Tanggapan Kesehatan COVID-19 untuk Marinir, tim membangun uji diagnostik berbasis AS berbasis host untuk infeksi SARS-CoV-2. Pengujian tersebut dilaporkan menunjukkan “konsistensi dan kekokohan yang unggul dari biomarker AS untuk infeksi virus.”
Uji diagnostik mikrofluida mencatat akurasi yang hampir sempurna dalam kohort independen dengan sampel darah dunia nyata sebesar 98,4%. Pendekatannya sama mengesankannya dalam kasus tanpa gejala yang hanya dapat dideteksi dengan tes antigen cepat yang ada dengan akurasi 60%, menurut Phys.org.
“[Most tests] mengandalkan prinsip yang sama, yaitu Anda telah mengumpulkan sejumlah materi virus yang dapat dideteksi, misalnya di hidung Anda. Itu menimbulkan tantangan ketika masih di awal jendela waktu infeksi, dan Anda belum mengumpulkan banyak materi virus, atau Anda tidak menunjukkan gejala, ”penulis utama studi Frank Zhang, yang bekerja pada proyek tersebut sebagai peneliti di Flatiron. Pusat Institut Biologi Komputasi di New York City, mengatakan, per outlet berita.
“Sangat mengejutkan bahwa itu bekerja dengan sangat baik. Ini adalah pendekatan alternatif dan pelengkap yang menjanjikan untuk tes PCR konvensional,” kata Zhang, sekarang asisten profesor di Cedars-Sinai Medical Center di Los Angeles, tentang pengujian baru tersebut.
Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit (CDC) mengeluarkan pedoman yang mengatakan tes antibodi mungkin tidak selalu memberikan hasil yang akurat untuk mengidentifikasi infeksi COVID-19. Pixabay